Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms