Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SUMO4Q6EEV6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms