Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms