Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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