Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIF1Q5UIP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms