Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms