Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA8Q53HL2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms