Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP13-3Q3SY46 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms