Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms