Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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