Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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