Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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