Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms