Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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