Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRCAPQ14761 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms