Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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