Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBA3CQ13748 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBA3CQ13748 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBA3CQ13748 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TUBA3CQ13748 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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