Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms