Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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