Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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