Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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