Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms