Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNEQ04844 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms