Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARID5AQ03989 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms