Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms