Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms