Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms