Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms