Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VBP1P61758 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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