Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms