Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RANGAP1P46060 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms