Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA4P43681 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms