Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms