Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms