Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5C1P36542 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms