Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms