Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms