Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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