Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms