Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms