Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX11O75558 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
STX11O75558 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
STX11O75558 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX11O75558 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms