Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSL4O60488 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACSL4O60488 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms