Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPLO60437 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPLO60437 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms