Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms