Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms