Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms