Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms