Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4E171 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4E171 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
B4E171 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms