Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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