Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms